يعد جامع الثقلين من أقدم الجوامع الموجودة في ناحية تازة خورماتو، التابعة لمحافظة كركوك، يمتد تاريخ الجامع إلى أكثر من مئة عام، حيث يعود تاريخ بنائه إلى حوالي عام ١٩١٩ وفقًا لما ذكره والد السيد إبراهيم عباس الموسوي، ودوريش جعفر (أبوشكور)، رحمها الله، فقد كان للعثمانيين جنود في المنطقة، وفي أحد الأيام الباردة جدًا، قام الجنود بكسر أخشاب الجامع واستخدموها حطباً للتدفئة.
في نهاية السبعينيات، قام حزب البعث بتحويل ملكية الجامع إلى وزارة الأوقاف والشؤون الدينية، وأصبحت تابعة لها، حيث كان يقام في الجامع مجالس العزاء في أيام شهر محرم الحرام وبقية المناسبات الدينية، وكان الملا موسى صابر يقيم صلاة الجماعة في هذا الجامع، وكذلك الملا حيدر، (رحمهما الله).
في بداية التسعينيات، كان الحاج ابو شكور يتولى إدارة الجامع بعد وفاته، قامت الحكومة البعثية الصدامية بتدمير الجامع وحرقها ونهبها وفي نهاية عام ١٩٩٢، بدأت إدارة الجامع بناء وإعادة تعمير الجامع، وتولى إدارة الجامع بعد ذلك السيد إبراهيم الموسوي، وفي عام ٢٠٢١ تم بناء قاعة لإقامة مجالس العزاء والمناسبات الدينية، ولا يزال قائمًا حتى اليوم، حيث يستمر فيه أداء الصلاة وأعمال العبادة ومجالس أهل البيت (عليهم السلام.)